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肝癌外显子测序研究的重大意义
文章来源:江苏菲亚生物科技有限公司   添加时间:2017/1/17 9:26:22 点击率:2193

选择肝细胞癌,特别是肝内转移性肝细胞癌作为研究对象,转移发生率与肝癌的生物学特性密切有关,特别是肝癌细胞内促转移基因和抑癌基因的平衡失调在肝癌转移中起到重要作用。因此,利用先进的分析技术,系统研究肝癌和正常细胞之间基因谱系的差别,就有可能发现与肝癌转移密切相关的基因变异类型,为临床诊断和治疗提供新指标和新靶点。

具体来讲,此项研究选择了10例HBV阳性肝癌患者,收集每一例患者手术后的癌旁组织、原发癌组织和肝内转移的门静脉癌栓。利用基因组学领域内的DNA序列分析仪,对这些样本进行全外显子组测序分析,结合生物信息学技术仔细识别每一例患者的三种样本间的DNA序列的微小差异,从而发现在肿瘤细胞存在347个突变基因,平均每个肿瘤样本有30-40个基因突变,其中大多数基因突变是第一次在肝癌细胞中被发现,并且在原发灶和转移灶中同时出现。说明肝癌的发病和转移与基因突变密切相关,并且转移相关基因在原发癌中就已经发生了突变。随后研究人员在更大规模的肝癌样本中对基因突变进行了验证,证明研究的结果是准确可信的。

此外,研究人员又利用RNA干扰技术评估了91个已证实存在突变的基因对肝癌细胞生长的影响,发现ARID1A、VCAM1和CDK14等基因突变可能与肝癌发生、转移密切相关。特别是,ARID1A基因突变在多种人类肿瘤中均被发现有突变发生,比如:卵巢癌、子宫内膜癌、胃癌、肾癌、膀胱癌等。在我们的这项研究中,ARID1A基因在13%肝癌组织中均发生突变。有同行预测,该基因有可能是继TP53基因之后,又一个肿瘤基础研究和开发应用的明星分子。此外,VCAM1除了突变外,还在多数肝癌样本中表达下降。而与细胞增殖相关的CDK14基因突变则会增强该基因功能,导致细胞生长加快,促进转移。
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